A história começa quando um menino chamado Kaiba acorda sem suas memórias em um quarto arruinado, tudo que ele tem é um pingente com uma foto de uma menina desconhecida. Kaiba segue recuperando suas memórias através de suas viagens, enquanto que a menina do pingente luta com suas próprias convicções e seu passado, que pode estar interligado com as origens de Kaiba.