Kojiro Shindo, Diretor-Geral do Escritório de Planejamento de Políticas Públicas, está no aeroporto de Haneda para uma viagem de negócios. Enquanto o avião está na pista, uma estrutura gigante surge de repente do ar e a aeronave que transporta Shindo e outros 251 passageiros é levada para dentro da mesma. Depois que todos desembarcam, um homem que se parece com um ser humano comum aparece e garante que ninguém está em perigo, mas que ele, Yaha-kui zaShunina, um Anisotoron, irá intervir nos assuntos internos do Japão dali pra frente.