A Organização de Segurança Chaldea foi fundada para se dedicar à preservação da continuidade da história humana. Eles observam um mundo que a magia é incapaz de observar e que a ciência é incapaz de mensurar, para evitar a extinção certeira da humanidade. Contudo, um dia, o futuro que Chaldea observa desaparece e a extinção da humanidade em 2017 será certeira. Ou melhor ainda, já foi. A causa remonta ao ano de 2004 CE e está ligada à cidade de Fuyuki, no interior do Japão. Nela, surge de repente uma "região inobservável."